关于公司扣员工社保的钱去向问题，需结合社保缴纳流程和法律规定来明确。
公司从员工工资中扣除的社保费用，最终会缴纳至当地社会保险经办机构，分别计入职工的社保个人账户和统筹基金。
1. 若存在养老保险扣除：员工个人缴纳部分（通常为工资基数的8%）会记入养老保险个人账户，用于未来计算退休金；公司缴纳部分则进入统筹基金，用于支付当前退休人员的养老金。
2. 若存在医疗保险扣除：员工个人缴纳部分（通常为工资基数的2%）进入医保个人账户，可用于门诊、药店购药等；公司缴纳部分进入统筹基金，用于住院报销等统筹支付项目。
3. 若存在失业保险扣除：员工个人缴纳部分（通常为工资基数的
0.5%）与公司缴纳部分共同进入失业保险统筹基金，用于员工失业时领取失业金。
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针对公司扣员工社保费用的去向，可依据《社会保险法》的具体条款进行法律分析。
根据2018年修正的《中华人民共和国社会保险法》第十二条规定：“用人单位应当按照国家规定的本单位职工工资总额的比例缴纳基本养老保险费，记入基本养老保险统筹基金。职工应当按照国家规定的本人工资的比例缴纳基本养老保险费，记入个人账户。” 同时，第六十条明确：“职工应当缴纳的社会保险费由用人单位代扣代缴，用人单位应当按月将缴纳社会保险费的明细情况告知本人。”
结合问题，公司扣除的员工社保费用，需按上述法律规定，将员工个人缴纳部分分别记入养老、医疗等个人账户，公司缴纳部分及部分个人缴纳部分（如失业）进入统筹基金，并统一缴纳至社保经办机构。因此，员工被扣的社保费用并非由公司留存，而是依法缴至社保机构，用于保障员工的社保权益。
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公司扣员工社保费用的去向可能受以下特殊情况影响：
1. 地方政府调整社保缴费比例：例如，某地政府因社保基金压力，临时调整养老保险个人缴费比例从8%降至7%，此时公司扣除的社保费用会相应减少，员工需关注当地政策变化，避免误以为公司扣款错误。
2. 员工工资基数发生变化：若员工当月工资因绩效、奖金等因素大幅增加，社保缴费基数也会相应提高，导致公司扣除的社保费用增加。此时员工需核对工资条上的基数是否与实际工资一致，避免公司错误计算。
3. 公司申请社保缓缴：若公司因不可抗力（如疫情）向社保机构申请缓缴，可能暂时未将员工扣款缴至社保机构，但需在缓缴期限内补缴。此时员工需确认公司是否已获得缓缴批准，避免因断缴影响社保权益。
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公司扣员工社保费用的过程中，可能存在以下法律风险：
1. 公司未将扣款缴至社保机构的风险：例如，某公司每月从员工工资中扣除社保费用，但未实际向社保机构缴纳，导致员工社保账户显示断缴，无法正常享受医疗报销或养老保险待遇。此时员工不仅面临经济损失，还可能影响未来的退休权益。
2. 公司未按实际工资基数扣款的风险：例如，公司以当地最低工资标准作为社保缴费基数，而非员工实际工资，导致员工个人扣款金额低于法定标准，进而影响社保个人账户积累，最终导致退休金减少或医疗报销比例降低。

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